Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
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