Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms