Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms