Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FMODQ06828 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FMODQ06828 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FMODQ06828 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FMODQ06828 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FMODQ06828 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FMODQ06828 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FMODQ06828 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FMODQ06828 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FMODQ06828 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FMODQ06828 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FMODQ06828 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FMODQ06828 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FMODQ06828 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FMODQ06828 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FMODQ06828 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FMODQ06828 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FMODQ06828 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FMODQ06828 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FMODQ06828 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FMODQ06828 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FMODQ06828 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FMODQ06828 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FMODQ06828 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FMODQ06828 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FMODQ06828 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FMODQ06828 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FMODQ06828 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FMODQ06828 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FMODQ06828 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FMODQ06828 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FMODQ06828 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FMODQ06828 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FMODQ06828 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FMODQ06828 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FMODQ06828 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FMODQ06828 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FMODQ06828 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FMODQ06828 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FMODQ06828 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FMODQ06828 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FMODQ06828 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FMODQ06828 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FMODQ06828 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FMODQ06828 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FMODQ06828 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FMODQ06828 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FMODQ06828 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FMODQ06828 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FMODQ06828 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FMODQ06828 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FMODQ06828 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FMODQ06828 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FMODQ06828 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FMODQ06828 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FMODQ06828 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FMODQ06828 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FMODQ06828 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FMODQ06828 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FMODQ06828 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FMODQ06828 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FMODQ06828 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FMODQ06828 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FMODQ06828 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FMODQ06828 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FMODQ06828 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FMODQ06828 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FMODQ06828 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FMODQ06828 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FMODQ06828 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FMODQ06828 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FMODQ06828 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FMODQ06828 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FMODQ06828 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FMODQ06828 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FMODQ06828 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FMODQ06828 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FMODQ06828 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FMODQ06828 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FMODQ06828 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FMODQ06828 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FMODQ06828 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FMODQ06828 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FMODQ06828 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FMODQ06828 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FMODQ06828 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FMODQ06828 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FMODQ06828 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FMODQ06828 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FMODQ06828 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FMODQ06828 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FMODQ06828 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FMODQ06828 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FMODQ06828 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FMODQ06828 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FMODQ06828 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FMODQ06828 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FMODQ06828 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FMODQ06828 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FMODQ06828 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms