Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms