Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms