Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms