Protein–RNA interactions for Protein: Q02338

BDH1, D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDH1Q02338 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BDH1Q02338 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BDH1Q02338 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BDH1Q02338 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BDH1Q02338 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BDH1Q02338 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BDH1Q02338 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BDH1Q02338 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BDH1Q02338 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BDH1Q02338 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BDH1Q02338 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BDH1Q02338 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BDH1Q02338 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
BDH1Q02338 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms