Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RHDQ02161 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RHDQ02161 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RHDQ02161 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RHDQ02161 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RHDQ02161 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RHDQ02161 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RHDQ02161 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RHDQ02161 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RHDQ02161 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RHDQ02161 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RHDQ02161 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RHDQ02161 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RHDQ02161 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RHDQ02161 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RHDQ02161 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RHDQ02161 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RHDQ02161 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RHDQ02161 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RHDQ02161 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RHDQ02161 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RHDQ02161 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RHDQ02161 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RHDQ02161 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RHDQ02161 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RHDQ02161 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RHDQ02161 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RHDQ02161 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RHDQ02161 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RHDQ02161 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RHDQ02161 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RHDQ02161 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RHDQ02161 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RHDQ02161 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RHDQ02161 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RHDQ02161 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RHDQ02161 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RHDQ02161 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RHDQ02161 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RHDQ02161 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RHDQ02161 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RHDQ02161 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RHDQ02161 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RHDQ02161 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RHDQ02161 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RHDQ02161 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RHDQ02161 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RHDQ02161 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RHDQ02161 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RHDQ02161 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RHDQ02161 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RHDQ02161 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RHDQ02161 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RHDQ02161 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RHDQ02161 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RHDQ02161 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
RHDQ02161 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RHDQ02161 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RHDQ02161 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RHDQ02161 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RHDQ02161 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RHDQ02161 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RHDQ02161 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RHDQ02161 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RHDQ02161 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RHDQ02161 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RHDQ02161 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RHDQ02161 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RHDQ02161 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RHDQ02161 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RHDQ02161 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RHDQ02161 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RHDQ02161 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RHDQ02161 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RHDQ02161 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RHDQ02161 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RHDQ02161 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RHDQ02161 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RHDQ02161 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RHDQ02161 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RHDQ02161 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RHDQ02161 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RHDQ02161 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RHDQ02161 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RHDQ02161 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RHDQ02161 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RHDQ02161 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RHDQ02161 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RHDQ02161 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RHDQ02161 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RHDQ02161 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RHDQ02161 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RHDQ02161 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RHDQ02161 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RHDQ02161 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RHDQ02161 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RHDQ02161 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RHDQ02161 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RHDQ02161 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RHDQ02161 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms