Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms