Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms