Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VBP1P61758 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VBP1P61758 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VBP1P61758 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VBP1P61758 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VBP1P61758 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VBP1P61758 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VBP1P61758 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VBP1P61758 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VBP1P61758 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VBP1P61758 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VBP1P61758 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VBP1P61758 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VBP1P61758 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VBP1P61758 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VBP1P61758 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VBP1P61758 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VBP1P61758 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VBP1P61758 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VBP1P61758 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VBP1P61758 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VBP1P61758 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VBP1P61758 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VBP1P61758 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VBP1P61758 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VBP1P61758 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VBP1P61758 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VBP1P61758 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VBP1P61758 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VBP1P61758 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VBP1P61758 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VBP1P61758 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VBP1P61758 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VBP1P61758 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VBP1P61758 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VBP1P61758 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VBP1P61758 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VBP1P61758 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VBP1P61758 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VBP1P61758 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VBP1P61758 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VBP1P61758 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VBP1P61758 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VBP1P61758 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VBP1P61758 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VBP1P61758 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VBP1P61758 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VBP1P61758 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VBP1P61758 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VBP1P61758 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VBP1P61758 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VBP1P61758 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VBP1P61758 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VBP1P61758 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VBP1P61758 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VBP1P61758 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VBP1P61758 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VBP1P61758 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VBP1P61758 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VBP1P61758 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VBP1P61758 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VBP1P61758 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VBP1P61758 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VBP1P61758 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VBP1P61758 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VBP1P61758 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VBP1P61758 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VBP1P61758 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VBP1P61758 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VBP1P61758 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VBP1P61758 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VBP1P61758 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VBP1P61758 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VBP1P61758 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VBP1P61758 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VBP1P61758 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VBP1P61758 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VBP1P61758 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VBP1P61758 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VBP1P61758 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VBP1P61758 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VBP1P61758 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VBP1P61758 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VBP1P61758 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VBP1P61758 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VBP1P61758 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VBP1P61758 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VBP1P61758 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VBP1P61758 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VBP1P61758 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VBP1P61758 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VBP1P61758 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VBP1P61758 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VBP1P61758 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VBP1P61758 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VBP1P61758 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VBP1P61758 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VBP1P61758 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VBP1P61758 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VBP1P61758 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms