Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms