Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
UBE2NP61088 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
UBE2NP61088 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
UBE2NP61088 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
UBE2NP61088 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
UBE2NP61088 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBE2NP61088 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBE2NP61088 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBE2NP61088 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBE2NP61088 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBE2NP61088 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBE2NP61088 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBE2NP61088 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBE2NP61088 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBE2NP61088 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBE2NP61088 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBE2NP61088 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBE2NP61088 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBE2NP61088 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBE2NP61088 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBE2NP61088 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBE2NP61088 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBE2NP61088 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBE2NP61088 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBE2NP61088 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBE2NP61088 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms