Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRG3P56975 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRG3P56975 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NRG3P56975 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRG3P56975 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRG3P56975 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRG3P56975 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRG3P56975 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRG3P56975 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRG3P56975 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRG3P56975 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NRG3P56975 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRG3P56975 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NRG3P56975 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRG3P56975 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRG3P56975 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRG3P56975 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRG3P56975 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRG3P56975 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRG3P56975 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRG3P56975 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRG3P56975 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRG3P56975 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NRG3P56975 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRG3P56975 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRG3P56975 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRG3P56975 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRG3P56975 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRG3P56975 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRG3P56975 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRG3P56975 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRG3P56975 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRG3P56975 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRG3P56975 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRG3P56975 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRG3P56975 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRG3P56975 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRG3P56975 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRG3P56975 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRG3P56975 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRG3P56975 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRG3P56975 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRG3P56975 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NRG3P56975 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRG3P56975 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRG3P56975 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRG3P56975 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NRG3P56975 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRG3P56975 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NRG3P56975 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRG3P56975 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRG3P56975 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRG3P56975 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRG3P56975 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRG3P56975 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRG3P56975 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRG3P56975 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRG3P56975 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRG3P56975 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NRG3P56975 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRG3P56975 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRG3P56975 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRG3P56975 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NRG3P56975 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRG3P56975 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRG3P56975 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRG3P56975 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRG3P56975 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRG3P56975 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRG3P56975 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRG3P56975 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRG3P56975 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRG3P56975 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRG3P56975 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRG3P56975 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRG3P56975 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRG3P56975 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRG3P56975 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRG3P56975 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRG3P56975 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NRG3P56975 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRG3P56975 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRG3P56975 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRG3P56975 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRG3P56975 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRG3P56975 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRG3P56975 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRG3P56975 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NRG3P56975 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRG3P56975 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRG3P56975 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRG3P56975 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRG3P56975 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRG3P56975 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRG3P56975 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRG3P56975 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRG3P56975 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRG3P56975 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRG3P56975 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRG3P56975 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms