Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms