Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
COPAP53621 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPAP53621 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPAP53621 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPAP53621 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPAP53621 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
COPAP53621 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
COPAP53621 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
COPAP53621 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPAP53621 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPAP53621 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPAP53621 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPAP53621 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPAP53621 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPAP53621 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
COPAP53621 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPAP53621 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPAP53621 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPAP53621 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
COPAP53621 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPAP53621 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPAP53621 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPAP53621 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPAP53621 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPAP53621 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPAP53621 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPAP53621 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
COPAP53621 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPAP53621 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPAP53621 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPAP53621 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPAP53621 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPAP53621 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPAP53621 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPAP53621 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPAP53621 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPAP53621 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPAP53621 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPAP53621 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPAP53621 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPAP53621 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPAP53621 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPAP53621 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPAP53621 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPAP53621 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPAP53621 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPAP53621 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPAP53621 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPAP53621 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPAP53621 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPAP53621 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPAP53621 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPAP53621 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPAP53621 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPAP53621 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPAP53621 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPAP53621 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPAP53621 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPAP53621 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPAP53621 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPAP53621 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPAP53621 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPAP53621 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPAP53621 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
COPAP53621 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPAP53621 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPAP53621 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPAP53621 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPAP53621 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPAP53621 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPAP53621 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPAP53621 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPAP53621 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPAP53621 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPAP53621 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPAP53621 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPAP53621 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPAP53621 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPAP53621 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPAP53621 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPAP53621 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPAP53621 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
COPAP53621 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
COPAP53621 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPAP53621 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPAP53621 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPAP53621 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPAP53621 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPAP53621 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPAP53621 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPAP53621 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPAP53621 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPAP53621 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPAP53621 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPAP53621 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPAP53621 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPAP53621 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPAP53621 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPAP53621 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPAP53621 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms