Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
THOP1P52888 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
THOP1P52888 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
THOP1P52888 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
THOP1P52888 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
THOP1P52888 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
THOP1P52888 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
THOP1P52888 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
THOP1P52888 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
THOP1P52888 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
THOP1P52888 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
THOP1P52888 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
THOP1P52888 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
THOP1P52888 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
THOP1P52888 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
THOP1P52888 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
THOP1P52888 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
THOP1P52888 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
THOP1P52888 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
THOP1P52888 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
THOP1P52888 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
THOP1P52888 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
THOP1P52888 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
THOP1P52888 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
THOP1P52888 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
THOP1P52888 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
THOP1P52888 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
THOP1P52888 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
THOP1P52888 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
THOP1P52888 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
THOP1P52888 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
THOP1P52888 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
THOP1P52888 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
THOP1P52888 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
THOP1P52888 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
THOP1P52888 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
THOP1P52888 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
THOP1P52888 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
THOP1P52888 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
THOP1P52888 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
THOP1P52888 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
THOP1P52888 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
THOP1P52888 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
THOP1P52888 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
THOP1P52888 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
THOP1P52888 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
THOP1P52888 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
THOP1P52888 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
THOP1P52888 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
THOP1P52888 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
THOP1P52888 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
THOP1P52888 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
THOP1P52888 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
THOP1P52888 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
THOP1P52888 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
THOP1P52888 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
THOP1P52888 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
THOP1P52888 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
THOP1P52888 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
THOP1P52888 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
THOP1P52888 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
THOP1P52888 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
THOP1P52888 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
THOP1P52888 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
THOP1P52888 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
THOP1P52888 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
THOP1P52888 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
THOP1P52888 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
THOP1P52888 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
THOP1P52888 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
THOP1P52888 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
THOP1P52888 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
THOP1P52888 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
THOP1P52888 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
THOP1P52888 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
THOP1P52888 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
THOP1P52888 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
THOP1P52888 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
THOP1P52888 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
THOP1P52888 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
THOP1P52888 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
THOP1P52888 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
THOP1P52888 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
THOP1P52888 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
THOP1P52888 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
THOP1P52888 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
THOP1P52888 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
THOP1P52888 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
THOP1P52888 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
THOP1P52888 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
THOP1P52888 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
THOP1P52888 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
THOP1P52888 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
THOP1P52888 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
THOP1P52888 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
THOP1P52888 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
THOP1P52888 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
THOP1P52888 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
THOP1P52888 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
THOP1P52888 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms