Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LUMP51884 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LUMP51884 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LUMP51884 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LUMP51884 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LUMP51884 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LUMP51884 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LUMP51884 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LUMP51884 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LUMP51884 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LUMP51884 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LUMP51884 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LUMP51884 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LUMP51884 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LUMP51884 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LUMP51884 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LUMP51884 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LUMP51884 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LUMP51884 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LUMP51884 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LUMP51884 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LUMP51884 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LUMP51884 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LUMP51884 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LUMP51884 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LUMP51884 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LUMP51884 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LUMP51884 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LUMP51884 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LUMP51884 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LUMP51884 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LUMP51884 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LUMP51884 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LUMP51884 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LUMP51884 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LUMP51884 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LUMP51884 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LUMP51884 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LUMP51884 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LUMP51884 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LUMP51884 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LUMP51884 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LUMP51884 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LUMP51884 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LUMP51884 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LUMP51884 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LUMP51884 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LUMP51884 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LUMP51884 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LUMP51884 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LUMP51884 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LUMP51884 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LUMP51884 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LUMP51884 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LUMP51884 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LUMP51884 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LUMP51884 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LUMP51884 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LUMP51884 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LUMP51884 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LUMP51884 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LUMP51884 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LUMP51884 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LUMP51884 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LUMP51884 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LUMP51884 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LUMP51884 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LUMP51884 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LUMP51884 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LUMP51884 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LUMP51884 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LUMP51884 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LUMP51884 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LUMP51884 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LUMP51884 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LUMP51884 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LUMP51884 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LUMP51884 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LUMP51884 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LUMP51884 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LUMP51884 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LUMP51884 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LUMP51884 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LUMP51884 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LUMP51884 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LUMP51884 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LUMP51884 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LUMP51884 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LUMP51884 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LUMP51884 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LUMP51884 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LUMP51884 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LUMP51884 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LUMP51884 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LUMP51884 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LUMP51884 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LUMP51884 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LUMP51884 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LUMP51884 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LUMP51884 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms