Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB28P51157 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB28P51157 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB28P51157 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB28P51157 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB28P51157 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB28P51157 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB28P51157 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB28P51157 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB28P51157 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB28P51157 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB28P51157 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB28P51157 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB28P51157 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB28P51157 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB28P51157 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB28P51157 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB28P51157 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB28P51157 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB28P51157 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB28P51157 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB28P51157 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB28P51157 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB28P51157 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB28P51157 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB28P51157 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB28P51157 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB28P51157 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB28P51157 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB28P51157 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB28P51157 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB28P51157 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB28P51157 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB28P51157 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB28P51157 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB28P51157 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB28P51157 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB28P51157 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB28P51157 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB28P51157 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB28P51157 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB28P51157 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB28P51157 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB28P51157 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB28P51157 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB28P51157 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB28P51157 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB28P51157 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB28P51157 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB28P51157 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB28P51157 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB28P51157 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB28P51157 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB28P51157 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB28P51157 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB28P51157 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB28P51157 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB28P51157 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB28P51157 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB28P51157 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB28P51157 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB28P51157 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB28P51157 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB28P51157 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB28P51157 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB28P51157 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB28P51157 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB28P51157 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB28P51157 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB28P51157 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB28P51157 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB28P51157 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB28P51157 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB28P51157 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB28P51157 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB28P51157 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB28P51157 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB28P51157 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB28P51157 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB28P51157 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB28P51157 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB28P51157 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB28P51157 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB28P51157 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB28P51157 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB28P51157 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB28P51157 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB28P51157 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB28P51157 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB28P51157 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB28P51157 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB28P51157 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB28P51157 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB28P51157 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB28P51157 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB28P51157 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB28P51157 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB28P51157 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB28P51157 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB28P51157 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms