Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PIP4K2AP48426 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIP4K2AP48426 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIP4K2AP48426 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIP4K2AP48426 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIP4K2AP48426 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIP4K2AP48426 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIP4K2AP48426 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIP4K2AP48426 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PIP4K2AP48426 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms