Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTX2P32243 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTX2P32243 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTX2P32243 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTX2P32243 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTX2P32243 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTX2P32243 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
OTX2P32243 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTX2P32243 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
OTX2P32243 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTX2P32243 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTX2P32243 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTX2P32243 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
OTX2P32243 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTX2P32243 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTX2P32243 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTX2P32243 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTX2P32243 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
OTX2P32243 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTX2P32243 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTX2P32243 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTX2P32243 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTX2P32243 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTX2P32243 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTX2P32243 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTX2P32243 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTX2P32243 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTX2P32243 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTX2P32243 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTX2P32243 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTX2P32243 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTX2P32243 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTX2P32243 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTX2P32243 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTX2P32243 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTX2P32243 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTX2P32243 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTX2P32243 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTX2P32243 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTX2P32243 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTX2P32243 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTX2P32243 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTX2P32243 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTX2P32243 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTX2P32243 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
OTX2P32243 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTX2P32243 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTX2P32243 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTX2P32243 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTX2P32243 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
OTX2P32243 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTX2P32243 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTX2P32243 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTX2P32243 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTX2P32243 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTX2P32243 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTX2P32243 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTX2P32243 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTX2P32243 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTX2P32243 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTX2P32243 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTX2P32243 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTX2P32243 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTX2P32243 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTX2P32243 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTX2P32243 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTX2P32243 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTX2P32243 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTX2P32243 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTX2P32243 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTX2P32243 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTX2P32243 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTX2P32243 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
OTX2P32243 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTX2P32243 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTX2P32243 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTX2P32243 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTX2P32243 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTX2P32243 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTX2P32243 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTX2P32243 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTX2P32243 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTX2P32243 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTX2P32243 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
OTX2P32243 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTX2P32243 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTX2P32243 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTX2P32243 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTX2P32243 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
OTX2P32243 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTX2P32243 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
OTX2P32243 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTX2P32243 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTX2P32243 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTX2P32243 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTX2P32243 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTX2P32243 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTX2P32243 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTX2P32243 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTX2P32243 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms