Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
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