Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLD1P28340 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLD1P28340 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
POLD1P28340 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLD1P28340 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLD1P28340 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLD1P28340 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLD1P28340 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLD1P28340 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLD1P28340 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLD1P28340 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLD1P28340 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLD1P28340 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLD1P28340 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLD1P28340 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLD1P28340 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLD1P28340 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLD1P28340 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLD1P28340 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
POLD1P28340 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLD1P28340 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLD1P28340 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLD1P28340 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
POLD1P28340 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
POLD1P28340 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLD1P28340 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLD1P28340 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLD1P28340 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLD1P28340 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLD1P28340 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLD1P28340 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLD1P28340 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLD1P28340 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD1P28340 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD1P28340 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD1P28340 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD1P28340 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD1P28340 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD1P28340 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD1P28340 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD1P28340 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD1P28340 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD1P28340 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD1P28340 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD1P28340 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD1P28340 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD1P28340 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD1P28340 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD1P28340 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD1P28340 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD1P28340 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD1P28340 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD1P28340 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD1P28340 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD1P28340 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD1P28340 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD1P28340 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD1P28340 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD1P28340 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD1P28340 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD1P28340 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD1P28340 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD1P28340 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD1P28340 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD1P28340 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD1P28340 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD1P28340 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD1P28340 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD1P28340 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD1P28340 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD1P28340 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLD1P28340 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLD1P28340 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLD1P28340 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLD1P28340 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLD1P28340 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLD1P28340 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLD1P28340 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLD1P28340 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLD1P28340 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLD1P28340 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLD1P28340 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLD1P28340 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
POLD1P28340 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLD1P28340 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLD1P28340 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLD1P28340 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLD1P28340 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLD1P28340 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLD1P28340 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLD1P28340 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLD1P28340 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLD1P28340 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLD1P28340 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLD1P28340 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLD1P28340 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD1P28340 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD1P28340 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD1P28340 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD1P28340 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms