Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTX3P26022 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTX3P26022 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTX3P26022 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTX3P26022 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTX3P26022 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTX3P26022 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTX3P26022 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTX3P26022 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTX3P26022 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTX3P26022 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTX3P26022 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTX3P26022 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTX3P26022 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTX3P26022 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTX3P26022 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTX3P26022 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTX3P26022 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTX3P26022 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTX3P26022 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTX3P26022 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTX3P26022 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTX3P26022 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTX3P26022 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTX3P26022 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTX3P26022 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTX3P26022 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTX3P26022 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTX3P26022 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTX3P26022 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTX3P26022 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTX3P26022 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTX3P26022 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTX3P26022 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTX3P26022 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTX3P26022 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTX3P26022 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTX3P26022 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTX3P26022 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTX3P26022 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTX3P26022 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTX3P26022 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTX3P26022 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTX3P26022 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTX3P26022 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTX3P26022 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTX3P26022 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTX3P26022 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTX3P26022 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTX3P26022 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTX3P26022 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTX3P26022 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTX3P26022 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTX3P26022 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTX3P26022 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTX3P26022 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTX3P26022 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTX3P26022 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTX3P26022 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTX3P26022 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTX3P26022 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTX3P26022 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTX3P26022 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTX3P26022 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTX3P26022 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTX3P26022 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTX3P26022 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTX3P26022 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTX3P26022 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTX3P26022 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTX3P26022 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTX3P26022 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTX3P26022 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTX3P26022 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTX3P26022 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTX3P26022 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTX3P26022 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTX3P26022 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTX3P26022 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTX3P26022 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTX3P26022 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTX3P26022 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTX3P26022 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTX3P26022 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTX3P26022 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTX3P26022 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTX3P26022 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTX3P26022 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTX3P26022 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTX3P26022 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTX3P26022 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTX3P26022 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTX3P26022 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTX3P26022 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTX3P26022 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTX3P26022 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTX3P26022 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTX3P26022 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTX3P26022 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTX3P26022 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms