Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms