Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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