Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCC1P18754 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCC1P18754 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCC1P18754 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCC1P18754 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RCC1P18754 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCC1P18754 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCC1P18754 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RCC1P18754 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCC1P18754 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RCC1P18754 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RCC1P18754 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RCC1P18754 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RCC1P18754 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RCC1P18754 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RCC1P18754 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RCC1P18754 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RCC1P18754 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RCC1P18754 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RCC1P18754 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RCC1P18754 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RCC1P18754 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RCC1P18754 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RCC1P18754 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RCC1P18754 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RCC1P18754 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RCC1P18754 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RCC1P18754 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RCC1P18754 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RCC1P18754 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RCC1P18754 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RCC1P18754 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RCC1P18754 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RCC1P18754 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RCC1P18754 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RCC1P18754 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RCC1P18754 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RCC1P18754 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RCC1P18754 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RCC1P18754 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RCC1P18754 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RCC1P18754 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RCC1P18754 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RCC1P18754 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RCC1P18754 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RCC1P18754 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RCC1P18754 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RCC1P18754 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RCC1P18754 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RCC1P18754 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RCC1P18754 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RCC1P18754 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RCC1P18754 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RCC1P18754 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RCC1P18754 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RCC1P18754 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RCC1P18754 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RCC1P18754 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RCC1P18754 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RCC1P18754 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RCC1P18754 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RCC1P18754 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RCC1P18754 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RCC1P18754 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RCC1P18754 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RCC1P18754 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RCC1P18754 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RCC1P18754 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RCC1P18754 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RCC1P18754 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RCC1P18754 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RCC1P18754 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RCC1P18754 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RCC1P18754 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RCC1P18754 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RCC1P18754 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RCC1P18754 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RCC1P18754 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RCC1P18754 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RCC1P18754 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RCC1P18754 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RCC1P18754 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RCC1P18754 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RCC1P18754 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RCC1P18754 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RCC1P18754 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RCC1P18754 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RCC1P18754 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RCC1P18754 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RCC1P18754 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RCC1P18754 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RCC1P18754 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RCC1P18754 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RCC1P18754 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RCC1P18754 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RCC1P18754 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RCC1P18754 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RCC1P18754 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RCC1P18754 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RCC1P18754 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms