Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR1P18146 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR1P18146 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR1P18146 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR1P18146 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR1P18146 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR1P18146 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR1P18146 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR1P18146 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR1P18146 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR1P18146 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR1P18146 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR1P18146 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR1P18146 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR1P18146 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR1P18146 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR1P18146 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR1P18146 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR1P18146 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR1P18146 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR1P18146 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR1P18146 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR1P18146 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR1P18146 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR1P18146 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR1P18146 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR1P18146 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR1P18146 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR1P18146 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR1P18146 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR1P18146 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR1P18146 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR1P18146 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR1P18146 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR1P18146 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR1P18146 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR1P18146 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR1P18146 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR1P18146 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR1P18146 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR1P18146 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR1P18146 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR1P18146 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR1P18146 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR1P18146 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR1P18146 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR1P18146 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR1P18146 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR1P18146 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR1P18146 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR1P18146 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR1P18146 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR1P18146 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR1P18146 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR1P18146 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR1P18146 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR1P18146 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR1P18146 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR1P18146 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR1P18146 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR1P18146 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR1P18146 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR1P18146 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR1P18146 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR1P18146 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR1P18146 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR1P18146 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR1P18146 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR1P18146 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR1P18146 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR1P18146 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR1P18146 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR1P18146 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR1P18146 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR1P18146 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR1P18146 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR1P18146 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR1P18146 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR1P18146 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR1P18146 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR1P18146 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms