Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms