Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms