Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAV1P15498 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAV1P15498 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAV1P15498 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAV1P15498 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAV1P15498 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAV1P15498 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAV1P15498 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAV1P15498 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAV1P15498 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAV1P15498 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAV1P15498 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAV1P15498 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VAV1P15498 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAV1P15498 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAV1P15498 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAV1P15498 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAV1P15498 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAV1P15498 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAV1P15498 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAV1P15498 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAV1P15498 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAV1P15498 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAV1P15498 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAV1P15498 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAV1P15498 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAV1P15498 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAV1P15498 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAV1P15498 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAV1P15498 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAV1P15498 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAV1P15498 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAV1P15498 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAV1P15498 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAV1P15498 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAV1P15498 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAV1P15498 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAV1P15498 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAV1P15498 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAV1P15498 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAV1P15498 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAV1P15498 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAV1P15498 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAV1P15498 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAV1P15498 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAV1P15498 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAV1P15498 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAV1P15498 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAV1P15498 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAV1P15498 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAV1P15498 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAV1P15498 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAV1P15498 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAV1P15498 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAV1P15498 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAV1P15498 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAV1P15498 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAV1P15498 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAV1P15498 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAV1P15498 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAV1P15498 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAV1P15498 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAV1P15498 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAV1P15498 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAV1P15498 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAV1P15498 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAV1P15498 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAV1P15498 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
VAV1P15498 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
VAV1P15498 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAV1P15498 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAV1P15498 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAV1P15498 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAV1P15498 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAV1P15498 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAV1P15498 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAV1P15498 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAV1P15498 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAV1P15498 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAV1P15498 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAV1P15498 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAV1P15498 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAV1P15498 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAV1P15498 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAV1P15498 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAV1P15498 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAV1P15498 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAV1P15498 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAV1P15498 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAV1P15498 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAV1P15498 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAV1P15498 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAV1P15498 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAV1P15498 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAV1P15498 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
VAV1P15498 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAV1P15498 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAV1P15498 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAV1P15498 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAV1P15498 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms