Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC130P13994 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms