Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODC1P11926 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODC1P11926 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ODC1P11926 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODC1P11926 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODC1P11926 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODC1P11926 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODC1P11926 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODC1P11926 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODC1P11926 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODC1P11926 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODC1P11926 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODC1P11926 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODC1P11926 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODC1P11926 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODC1P11926 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODC1P11926 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODC1P11926 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODC1P11926 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODC1P11926 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODC1P11926 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODC1P11926 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODC1P11926 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODC1P11926 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ODC1P11926 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODC1P11926 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODC1P11926 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODC1P11926 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODC1P11926 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ODC1P11926 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODC1P11926 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODC1P11926 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODC1P11926 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODC1P11926 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODC1P11926 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODC1P11926 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODC1P11926 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ODC1P11926 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODC1P11926 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODC1P11926 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODC1P11926 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODC1P11926 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODC1P11926 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODC1P11926 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ODC1P11926 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ODC1P11926 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODC1P11926 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODC1P11926 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODC1P11926 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODC1P11926 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODC1P11926 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODC1P11926 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODC1P11926 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODC1P11926 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODC1P11926 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODC1P11926 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODC1P11926 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODC1P11926 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODC1P11926 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODC1P11926 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODC1P11926 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODC1P11926 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODC1P11926 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODC1P11926 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODC1P11926 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODC1P11926 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODC1P11926 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODC1P11926 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODC1P11926 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODC1P11926 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODC1P11926 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODC1P11926 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODC1P11926 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODC1P11926 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODC1P11926 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODC1P11926 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODC1P11926 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODC1P11926 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODC1P11926 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODC1P11926 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODC1P11926 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODC1P11926 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODC1P11926 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODC1P11926 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODC1P11926 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODC1P11926 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODC1P11926 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODC1P11926 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODC1P11926 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODC1P11926 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODC1P11926 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODC1P11926 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODC1P11926 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODC1P11926 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ODC1P11926 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ODC1P11926 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODC1P11926 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODC1P11926 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODC1P11926 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODC1P11926 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms