Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
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