Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
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