Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSLP07711 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSLP07711 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSLP07711 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSLP07711 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSLP07711 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSLP07711 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSLP07711 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSLP07711 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSLP07711 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSLP07711 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSLP07711 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSLP07711 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSLP07711 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSLP07711 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSLP07711 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSLP07711 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSLP07711 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSLP07711 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSLP07711 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSLP07711 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSLP07711 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSLP07711 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSLP07711 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSLP07711 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSLP07711 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSLP07711 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSLP07711 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSLP07711 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSLP07711 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSLP07711 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSLP07711 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSLP07711 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSLP07711 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSLP07711 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSLP07711 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSLP07711 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSLP07711 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSLP07711 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTSLP07711 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTSLP07711 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTSLP07711 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTSLP07711 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTSLP07711 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTSLP07711 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTSLP07711 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTSLP07711 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTSLP07711 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTSLP07711 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTSLP07711 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTSLP07711 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSLP07711 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSLP07711 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSLP07711 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSLP07711 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSLP07711 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSLP07711 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSLP07711 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSLP07711 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSLP07711 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSLP07711 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSLP07711 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSLP07711 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSLP07711 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSLP07711 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSLP07711 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSLP07711 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSLP07711 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSLP07711 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSLP07711 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSLP07711 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSLP07711 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSLP07711 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSLP07711 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSLP07711 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSLP07711 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSLP07711 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSLP07711 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSLP07711 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSLP07711 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSLP07711 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSLP07711 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSLP07711 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSLP07711 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSLP07711 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSLP07711 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSLP07711 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSLP07711 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSLP07711 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSLP07711 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSLP07711 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSLP07711 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSLP07711 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSLP07711 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSLP07711 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSLP07711 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSLP07711 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSLP07711 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSLP07711 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSLP07711 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms