Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC1P02654 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC1P02654 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC1P02654 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC1P02654 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC1P02654 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC1P02654 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC1P02654 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC1P02654 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC1P02654 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC1P02654 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC1P02654 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC1P02654 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC1P02654 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC1P02654 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC1P02654 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC1P02654 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC1P02654 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC1P02654 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC1P02654 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC1P02654 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC1P02654 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC1P02654 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC1P02654 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOC1P02654 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOC1P02654 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOC1P02654 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOC1P02654 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOC1P02654 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOC1P02654 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOC1P02654 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOC1P02654 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOC1P02654 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
APOC1P02654 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOC1P02654 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOC1P02654 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOC1P02654 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOC1P02654 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC1P02654 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC1P02654 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC1P02654 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC1P02654 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC1P02654 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC1P02654 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC1P02654 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC1P02654 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC1P02654 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC1P02654 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC1P02654 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC1P02654 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC1P02654 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC1P02654 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC1P02654 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC1P02654 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC1P02654 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC1P02654 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC1P02654 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC1P02654 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC1P02654 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC1P02654 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC1P02654 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC1P02654 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC1P02654 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC1P02654 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC1P02654 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC1P02654 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC1P02654 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC1P02654 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC1P02654 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC1P02654 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC1P02654 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC1P02654 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC1P02654 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC1P02654 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC1P02654 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC1P02654 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC1P02654 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC1P02654 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC1P02654 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC1P02654 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC1P02654 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC1P02654 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC1P02654 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC1P02654 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC1P02654 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC1P02654 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC1P02654 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC1P02654 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC1P02654 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC1P02654 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC1P02654 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC1P02654 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC1P02654 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC1P02654 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC1P02654 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC1P02654 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC1P02654 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC1P02654 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC1P02654 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC1P02654 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms