Protein–RNA interactions for Protein: P01782

IGHV3-9, Immunoglobulin heavy variable 3-9, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-9P01782 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGHV3-9P01782 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms