Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX58O95786 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX58O95786 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX58O95786 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX58O95786 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX58O95786 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX58O95786 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX58O95786 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX58O95786 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX58O95786 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX58O95786 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX58O95786 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX58O95786 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX58O95786 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX58O95786 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX58O95786 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX58O95786 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX58O95786 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX58O95786 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX58O95786 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX58O95786 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX58O95786 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX58O95786 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX58O95786 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX58O95786 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX58O95786 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX58O95786 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
DDX58O95786 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
DDX58O95786 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX58O95786 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX58O95786 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX58O95786 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX58O95786 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX58O95786 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX58O95786 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX58O95786 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX58O95786 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX58O95786 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX58O95786 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX58O95786 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX58O95786 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX58O95786 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX58O95786 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX58O95786 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX58O95786 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX58O95786 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX58O95786 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX58O95786 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX58O95786 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX58O95786 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX58O95786 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX58O95786 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX58O95786 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX58O95786 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX58O95786 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX58O95786 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX58O95786 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX58O95786 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX58O95786 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX58O95786 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX58O95786 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX58O95786 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX58O95786 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX58O95786 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX58O95786 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX58O95786 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX58O95786 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX58O95786 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX58O95786 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX58O95786 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX58O95786 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX58O95786 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX58O95786 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX58O95786 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX58O95786 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX58O95786 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX58O95786 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX58O95786 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX58O95786 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX58O95786 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX58O95786 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX58O95786 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX58O95786 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX58O95786 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX58O95786 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX58O95786 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX58O95786 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX58O95786 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX58O95786 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX58O95786 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX58O95786 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX58O95786 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX58O95786 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX58O95786 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX58O95786 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX58O95786 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX58O95786 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX58O95786 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX58O95786 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX58O95786 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms