Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
USP19O94966 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP19O94966 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP19O94966 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP19O94966 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP19O94966 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP19O94966 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP19O94966 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP19O94966 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP19O94966 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP19O94966 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP19O94966 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP19O94966 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP19O94966 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP19O94966 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP19O94966 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
USP19O94966 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP19O94966 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP19O94966 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP19O94966 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP19O94966 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP19O94966 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP19O94966 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP19O94966 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP19O94966 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP19O94966 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP19O94966 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP19O94966 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP19O94966 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP19O94966 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP19O94966 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP19O94966 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP19O94966 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP19O94966 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP19O94966 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP19O94966 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
USP19O94966 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP19O94966 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP19O94966 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP19O94966 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP19O94966 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP19O94966 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP19O94966 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP19O94966 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP19O94966 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
USP19O94966 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP19O94966 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP19O94966 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP19O94966 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP19O94966 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP19O94966 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
USP19O94966 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP19O94966 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP19O94966 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
USP19O94966 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP19O94966 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP19O94966 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP19O94966 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP19O94966 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP19O94966 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP19O94966 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP19O94966 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP19O94966 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP19O94966 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP19O94966 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP19O94966 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP19O94966 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP19O94966 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP19O94966 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP19O94966 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP19O94966 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
USP19O94966 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP19O94966 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP19O94966 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP19O94966 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP19O94966 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP19O94966 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP19O94966 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP19O94966 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP19O94966 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
USP19O94966 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP19O94966 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP19O94966 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP19O94966 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP19O94966 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP19O94966 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP19O94966 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP19O94966 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
USP19O94966 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP19O94966 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP19O94966 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP19O94966 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
USP19O94966 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP19O94966 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP19O94966 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP19O94966 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP19O94966 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP19O94966 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
USP19O94966 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
USP19O94966 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms