Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNKO75909 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNKO75909 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNKO75909 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNKO75909 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNKO75909 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNKO75909 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNKO75909 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNKO75909 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNKO75909 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNKO75909 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNKO75909 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNKO75909 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNKO75909 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNKO75909 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNKO75909 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNKO75909 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNKO75909 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNKO75909 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNKO75909 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNKO75909 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNKO75909 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNKO75909 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNKO75909 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNKO75909 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNKO75909 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNKO75909 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNKO75909 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNKO75909 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNKO75909 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNKO75909 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNKO75909 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNKO75909 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNKO75909 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNKO75909 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNKO75909 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNKO75909 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNKO75909 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNKO75909 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNKO75909 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNKO75909 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNKO75909 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNKO75909 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNKO75909 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNKO75909 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNKO75909 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNKO75909 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNKO75909 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCNKO75909 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCNKO75909 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCNKO75909 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCNKO75909 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCNKO75909 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCNKO75909 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCNKO75909 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCNKO75909 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCNKO75909 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCNKO75909 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCNKO75909 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCNKO75909 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCNKO75909 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCNKO75909 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCNKO75909 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCNKO75909 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCNKO75909 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNKO75909 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNKO75909 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNKO75909 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNKO75909 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNKO75909 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNKO75909 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNKO75909 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNKO75909 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNKO75909 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNKO75909 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNKO75909 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNKO75909 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNKO75909 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNKO75909 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNKO75909 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNKO75909 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNKO75909 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNKO75909 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNKO75909 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNKO75909 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNKO75909 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNKO75909 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNKO75909 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNKO75909 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNKO75909 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNKO75909 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNKO75909 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNKO75909 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNKO75909 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNKO75909 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNKO75909 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNKO75909 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNKO75909 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNKO75909 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNKO75909 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms