Protein–RNA interactions for Protein: O75841

UPK1B, Uroplakin-1b, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK1BO75841 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UPK1BO75841 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UPK1BO75841 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UPK1BO75841 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UPK1BO75841 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UPK1BO75841 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UPK1BO75841 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UPK1BO75841 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UPK1BO75841 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
UPK1BO75841 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UPK1BO75841 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UPK1BO75841 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UPK1BO75841 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UPK1BO75841 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
UPK1BO75841 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UPK1BO75841 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms