Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms