Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCO2O43819 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCO2O43819 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCO2O43819 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCO2O43819 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCO2O43819 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCO2O43819 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCO2O43819 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCO2O43819 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCO2O43819 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCO2O43819 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCO2O43819 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCO2O43819 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCO2O43819 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCO2O43819 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCO2O43819 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SCO2O43819 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCO2O43819 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SCO2O43819 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCO2O43819 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCO2O43819 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCO2O43819 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCO2O43819 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCO2O43819 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCO2O43819 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCO2O43819 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCO2O43819 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCO2O43819 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCO2O43819 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCO2O43819 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCO2O43819 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCO2O43819 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCO2O43819 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCO2O43819 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCO2O43819 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCO2O43819 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCO2O43819 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCO2O43819 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCO2O43819 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCO2O43819 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCO2O43819 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCO2O43819 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCO2O43819 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCO2O43819 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCO2O43819 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCO2O43819 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SCO2O43819 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCO2O43819 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCO2O43819 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCO2O43819 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCO2O43819 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCO2O43819 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCO2O43819 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCO2O43819 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCO2O43819 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCO2O43819 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCO2O43819 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCO2O43819 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCO2O43819 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCO2O43819 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCO2O43819 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCO2O43819 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCO2O43819 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCO2O43819 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCO2O43819 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCO2O43819 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCO2O43819 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCO2O43819 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCO2O43819 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCO2O43819 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCO2O43819 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCO2O43819 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCO2O43819 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCO2O43819 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCO2O43819 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCO2O43819 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCO2O43819 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCO2O43819 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCO2O43819 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCO2O43819 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCO2O43819 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SCO2O43819 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SCO2O43819 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCO2O43819 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCO2O43819 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCO2O43819 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCO2O43819 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCO2O43819 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SCO2O43819 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCO2O43819 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCO2O43819 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCO2O43819 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SCO2O43819 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCO2O43819 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCO2O43819 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCO2O43819 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCO2O43819 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCO2O43819 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCO2O43819 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCO2O43819 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms