Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms