Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms