Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
VGFO15240 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VGFO15240 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VGFO15240 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VGFO15240 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VGFO15240 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VGFO15240 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VGFO15240 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VGFO15240 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VGFO15240 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VGFO15240 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VGFO15240 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VGFO15240 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VGFO15240 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
VGFO15240 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VGFO15240 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VGFO15240 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VGFO15240 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VGFO15240 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VGFO15240 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VGFO15240 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VGFO15240 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VGFO15240 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VGFO15240 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VGFO15240 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VGFO15240 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VGFO15240 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VGFO15240 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VGFO15240 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VGFO15240 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VGFO15240 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VGFO15240 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VGFO15240 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VGFO15240 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VGFO15240 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VGFO15240 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VGFO15240 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VGFO15240 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VGFO15240 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VGFO15240 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VGFO15240 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VGFO15240 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VGFO15240 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VGFO15240 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VGFO15240 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VGFO15240 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VGFO15240 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VGFO15240 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VGFO15240 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VGFO15240 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VGFO15240 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VGFO15240 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VGFO15240 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VGFO15240 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VGFO15240 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VGFO15240 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VGFO15240 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VGFO15240 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VGFO15240 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VGFO15240 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VGFO15240 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VGFO15240 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VGFO15240 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VGFO15240 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VGFO15240 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VGFO15240 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VGFO15240 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VGFO15240 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VGFO15240 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VGFO15240 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VGFO15240 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VGFO15240 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VGFO15240 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VGFO15240 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VGFO15240 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VGFO15240 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VGFO15240 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VGFO15240 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VGFO15240 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VGFO15240 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VGFO15240 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VGFO15240 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VGFO15240 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VGFO15240 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VGFO15240 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VGFO15240 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VGFO15240 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VGFO15240 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VGFO15240 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VGFO15240 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VGFO15240 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VGFO15240 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VGFO15240 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VGFO15240 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VGFO15240 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VGFO15240 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VGFO15240 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VGFO15240 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
VGFO15240 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VGFO15240 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms