Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
E9PCH4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
E9PCH4 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
E9PCH4 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
E9PCH4 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
E9PCH4 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
E9PCH4 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
E9PCH4 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
E9PCH4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
E9PCH4 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
E9PCH4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
E9PCH4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
E9PCH4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
E9PCH4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
E9PCH4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
E9PCH4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
E9PCH4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
E9PCH4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
E9PCH4 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
E9PCH4 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
E9PCH4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
E9PCH4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
E9PCH4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
E9PCH4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
E9PCH4 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
E9PCH4 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
E9PCH4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
E9PCH4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
E9PCH4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
E9PCH4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
E9PCH4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
E9PCH4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
E9PCH4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
E9PCH4 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
E9PCH4 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
E9PCH4 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
E9PCH4 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
E9PCH4 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
E9PCH4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
E9PCH4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
E9PCH4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
E9PCH4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
E9PCH4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
E9PCH4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
E9PCH4 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
E9PCH4 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
E9PCH4 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
E9PCH4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
E9PCH4 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
E9PCH4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
E9PCH4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
E9PCH4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
E9PCH4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
E9PCH4 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
E9PCH4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
E9PCH4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
E9PCH4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
E9PCH4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
E9PCH4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
E9PCH4 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
E9PCH4 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
E9PCH4 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
E9PCH4 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
E9PCH4 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
E9PCH4 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
E9PCH4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
E9PCH4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
E9PCH4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
E9PCH4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
E9PCH4 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
E9PCH4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
E9PCH4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
E9PCH4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
E9PCH4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
E9PCH4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
E9PCH4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
E9PCH4 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
E9PCH4 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
E9PCH4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
E9PCH4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
E9PCH4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
E9PCH4 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
E9PCH4 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
E9PCH4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
E9PCH4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
E9PCH4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
E9PCH4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
E9PCH4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
E9PCH4 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
E9PCH4 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
E9PCH4 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
E9PCH4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
E9PCH4 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
E9PCH4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
E9PCH4 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
E9PCH4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
E9PCH4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
E9PCH4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
E9PCH4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
E9PCH4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms