Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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